Příběh houževnatého hrdiny Lloyda Banningse. Jen pár měsíců po událostech v Trails from Zero, usedl dočasný mír na celý Crossbell a Special Support Section se ocitá v nově nalezené slávě díky jejich hrdinským činům.
Avšak mír je brzy porušen s nástupem více organizací s neznámými motivy.
Osud městského státu - finální linie Crossbelu
Nejlepší jednotky Crossbellu - vyzkoušejte nové bojové schopnosti
Síly z minulosti - přeneste si uložená data z Trails from Zero pro zcela nový zážitek ze hry.
